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전공이야기33

TUNEL assay (parafin block or frozen block) TUNEL (TdT-mediated dUTP Nick-End Labeling) assay 란? TUNEL assay는 세포내의 DNA 단편화를 검출하는 방법 중 하나입니다. 이 방법은 TdT(Terminal deoxynucleotidyl transferase)라는 효소와 dUTP라는 뉴클레오티드, 그리고 bio-tin이 부착된 ddUTP(2'-deoxyuridine-5'-triphosphate)를 이용하여, 세포가 프로그램된 세포사멸(apoptosis)과정에서 DNA가 단편화될 때 발생하는 3'-OH 말단에 bio-tin을 부착시켜 검출하는 방식입니다. Parafin block 과 Frozen block 을 사용한 조직의 TUNEL assay 방법은 전체적인 과정은 동일하다. 단지, 각 block 의 특.. 2023. 12. 5.
DNA fragmentation assay (DNA Ladder assay) DNA fragmentation assay 란? 세포에 아포토시스(apoptosis)가 일어나면 엔도뉴클레아아제(Endonuclease)들이 nucleosome (DNA+histone proteins)사이의 linker region에서 DNA가 절단되어 180-200 base pair 길이의 일정한 크기의 배수로 작은 조각으로 만들어지기 때문에 세포고사(apoptosis) 확인을 위한 실험 방법입니다. DNA fragmentation assay는 다양한 방법으로 수행될 수 있으나, 여기에서는 젤전기영동(gel electrophoresis)으로 확인 하는 방법을 서술하겠습니다. 이 방법에서는 셀룰로오스나 아가로오스 등의 젤에 DNA 샘플을 올리고 전기장을 가하여 DNA 조각의 크기별로 분리하여 검출합니다... 2023. 12. 5.
Cell apoptosis를 확인하는 대표적인 4가지 실험 방법의 원리와 간단한 소개입니다 Cell Apoptosis 란? Cell apoptosis (세포고사)란 세포의 자발적인, 능동적인 세포사멸로, 프로그램된 세포사멸이라고도 합니다. 바이러스나 외부자극에 의한 DNA 손상 등으로 인해 불필요한 세포나 조직이 사라지는 과정입니다. 이 과정은 여러 가지 원인에 의해 유발되며, 세포 내부에서 일어나는 복잡한 신호전달 경로를 거쳐 진행됩니다. apoptotic cell은 DNA 단편화, 세포내 소기관(핵, 미토콘드리아 등)의 변화등의 다양한 특성을 갖습니다. Apoptosis를 확인할 수 있는 실험 방법들로는 DNA fragmentation assay, TUNEL assay, AnnexinV staining, AnnexinV-PI staining FACS analysis 등이 있습니다. 제시한 .. 2023. 6. 9.
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